佳里鎮舊稱『蕭壟』，為平埔族四大社之一，即新港社(今新市)，目加溜灣社(今善化)，麻荳社(今麻豆)，蕭壟社(今佳里鎮)。蕭壟的由來，指此處原為西拉雅族「Saulang社」的所在地，因而音譯為「蕭壟」。

佳里鎮在清末改隸台南府，日治時期1920年設置「佳里庄」，劃歸台南州北門郡管轄，1933年12月昇格為「佳里街」。二戰後改設為台南縣佳里鎮至今。